MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 1689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008381	A	6	6	2259	2264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008381	CGTCAC	2	12	2274	2285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008381	GCGG	2	8	3726	3733	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008381	GATA	2	8	3738	3745	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008381	GCT	2	6	3771	3776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008381	ACG	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008381	TGC	2	6	3828	3833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008381	GCC	2	6	3997	4002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008381	GC	4	8	4102	4109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008381	T	7	7	4130	4136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008381	CGC	2	6	4153	4158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008381	ATCG	2	8	4201	4208	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008381	TCT	2	6	4222	4227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008381	AAG	2	6	4234	4239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008381	CCA	2	6	4259	4264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008381	CAA	2	6	4283	4288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008381	CGGCAG	2	12	4306	4317	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008381	TC	3	6	4364	4369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008381	TTCT	2	8	5042	5049	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008381	TCT	2	6	5066	5071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008381	AAT	2	6	5090	5095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008381	CGGC	2	8	7507	7514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008381	CTG	2	6	7865	7870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008381	ATC	2	6	7919	7924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008381	TCGT	2	8	9789	9796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008381	AT	3	6	9801	9806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008381	GCT	2	6	10886	10891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008381	GGT	2	6	15116	15121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008381	CGC	2	6	15716	15721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_008381	TCA	2	6	15782	15787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008381	GCC	2	6	15834	15839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008381	CAG	2	6	15928	15933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008381	TCG	2	6	16031	16036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008381	CGG	2	6	16053	16058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008381	GCC	2	6	16208	16213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008381	CCG	2	6	16223	16228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_008381	GGC	2	6	16351	16356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008381	GGC	2	6	16358	16363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008381	CTG	2	6	16500	16505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008381	TCG	2	6	16511	16516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008381	CG	3	6	16524	16529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008381	GGC	2	6	16547	16552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008381	GCT	2	6	16563	16568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008381	ACG	2	6	16588	16593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008381	CGA	2	6	16598	16603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008381	ATG	2	6	16619	16624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008381	TG	3	6	16727	16732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008381	ATC	2	6	17303	17308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008381	TAC	2	6	17348	17353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008381	CGC	2	6	18294	18299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008381	GGC	2	6	18306	18311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008381	GCC	2	6	18318	18323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008381	CGC	2	6	18469	18474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008381	TGC	2	6	20671	20676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008381	AGA	2	6	20688	20693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008381	CGC	2	6	33852	33857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008381	AAG	2	6	33899	33904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008381	CAA	2	6	33927	33932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008381	TG	3	6	35217	35222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008381	ATG	2	6	35231	35236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008381	GCGCG	2	10	35237	35246	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_008381	TGT	2	6	35253	35258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008381	TGC	2	6	35302	35307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008381	CTC	2	6	35314	35319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_008381	CAT	2	6	35320	35325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008381	CCA	2	6	35328	35333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008381	CTG	2	6	35343	35348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008381	TGA	2	6	35361	35366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008381	CAT	2	6	35442	35447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008381	GC	3	6	35518	35523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008381	GCCC	2	8	35651	35658	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_008381	A	6	6	35659	35664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008381	GCG	2	6	35682	35687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008381	G	6	6	35695	35700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008381	GAAC	2	8	35706	35713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008381	GCTG	2	8	35750	35757	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008381	CTC	2	6	35802	35807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_008381	AGT	2	6	35858	35863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008381	TGC	2	6	35969	35974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008381	ACAT	2	8	35980	35987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008381	CAA	2	6	36002	36007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008381	GCA	2	6	36032	36037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008381	CGG	2	6	36143	36148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008381	ACAA	2	8	36168	36175	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008381	TGC	2	6	36182	36187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008381	C	6	6	36259	36264	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_008381	CCG	2	6	36301	36306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008381	GCA	2	6	36318	36323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008381	CGT	2	6	39880	39885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008381	AAAT	2	8	39891	39898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008381	ACTC	2	8	39911	39918	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008381	TGTCGC	2	12	40294	40305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008381	CCTAT	2	10	40351	40360	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_008381	GGT	2	6	40471	40476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008381	TCA	2	6	40484	40489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008381	CCG	2	6	40503	40508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008381	CG	3	6	40512	40517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008381	CGT	2	6	40550	40555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008381	CTTT	2	8	40594	40601	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008381	TCC	2	6	44310	44315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_008381	TGA	2	6	44703	44708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008381	T	7	7	44807	44813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008381	GTC	2	6	45617	45622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008381	GCC	2	6	45665	45670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_008381	CGC	2	6	45700	45705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008381	GAT	2	6	45718	45723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008381	TCG	2	6	45738	45743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008381	CCGG	2	8	45752	45759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008381	TGC	2	6	45795	45800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008381	GGT	2	6	45814	45819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008381	GCG	2	6	45876	45881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008381	ATT	2	6	46007	46012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008381	CGT	2	6	46039	46044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008381	CGC	2	6	46138	46143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_008381	GGTC	2	8	46175	46182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008381	CGG	2	6	46237	46242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008381	AT	3	6	46304	46309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008381	GTC	2	6	46320	46325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008381	CG	3	6	46348	46353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008381	TCG	2	6	46364	46369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008381	ACA	2	6	46396	46401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008381	CGGCA	2	10	46421	46430	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_008381	GAG	2	6	46578	46583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008381	TCG	2	6	46588	46593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008381	CCG	2	6	46696	46701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_008381	GC	3	6	46761	46766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008381	CCG	2	6	46806	46811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_008381	TGG	2	6	46884	46889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008381	TAT	2	6	46923	46928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008381	TCGA	2	8	46929	46936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008381	TCCT	2	8	47072	47079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008381	TTG	2	6	47148	47153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008381	GC	3	6	47179	47184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008381	GTC	2	6	47219	47224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008381	GCT	2	6	47305	47310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008381	GGC	2	6	47330	47335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008381	GACG	2	8	47359	47366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008381	GGC	2	6	47601	47606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008381	GTC	2	6	47618	47623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008381	CAC	2	6	47641	47646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_008381	T	6	6	47689	47694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008381	GCC	2	6	47698	47703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008381	GGA	2	6	47704	47709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008381	GAG	2	6	47813	47818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008381	ATC	2	6	47822	47827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008381	GAT	2	6	47906	47911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008381	GTG	2	6	47912	47917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008381	TGC	2	6	48040	48045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_008381	CGAT	2	8	48081	48088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008381	GCC	2	6	48092	48097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_008381	CTG	2	6	48104	48109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_008381	AGG	2	6	48351	48356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_008381	CCG	2	6	48707	48712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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163	NC_008381	GTC	2	6	48908	48913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_008381	CGA	2	6	49513	49518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_008381	CGA	2	6	49639	49644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_008381	CGG	2	6	49662	49667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_008381	CAG	2	6	49701	49706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_008381	GTC	2	6	49749	49754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_008381	CGA	2	6	49811	49816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_008381	CCG	2	6	49823	49828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_008381	GCTG	2	8	49873	49880	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
183	NC_008381	CGG	2	6	49885	49890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_008381	GACC	2	8	50565	50572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
194	NC_008381	CGG	2	6	50579	50584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_008381	CG	3	6	67288	67293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
278	NC_008381	T	8	8	67320	67327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_008381	CGCA	2	8	67336	67343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
280	NC_008381	CT	3	6	67788	67793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
281	NC_008381	TCC	2	6	70902	70907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
282	NC_008381	GAGG	2	8	74362	74369	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
283	NC_008381	T	6	6	75256	75261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_008381	A	7	7	75326	75332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_008381	TTG	2	6	92345	92350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_008381	ATT	2	6	97476	97481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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